Está ubicada en la zona oriental de Colombia en el departamento del Guainía, localizado al sur oriente de la Cordillera Oriental, en el municipio de Puerto Inírida, Vereda raudal de la Mapiripana, posee una sola vía de acceso por el río Guaviare. Se encuentra a 280 km del casco urbano del municipio de Mapiripán (lancha rápida) 8 horas y a 417 km del municipio de Puerto Inírida (lancha rápida 16 horas).
La Reserva ProAves Águila Harpía se caracteriza por poseer una selva transicional, ya que pasa de la sabana de la Orinoquía, bosques de galería a la selva húmeda Amazónica. Su estructura vegetal es de Bosque Denso Alto de Tierra Firme, vegetación transformada (pastos enmalezados), Bosque Denso Bajo de Tierra Firme y Bosque Denso Alto Inundable Heterogéneo: Las familias mejor representadas en número de especies son Mimosaceae, Moraceae, Melastomataceae, Lauraceae, Fabaceae, Euphorbiaceae, Rubiaceae, Burseraceae, Sapotaceae, y Myrtaceae.